Profil

MTs Negeri 2 Batam berdiri pada tahun 1996 oleh Departemen Agama Kota Batam. Pada awalnya MTs Negeri 2 Batam adalah sebuah sekolah PGA (Pendidikan Guru Agama) Swasta 4 tahun yang didirikan pada tahun 1968 oleh YP2I (Yayasan Pengembangan Pendidikan Islam) dibawah pimpinan Drs. Fauzi  Mahbub sebagai Kepala PGAS 4 tahun sampai tahun 1970 PGAS 4 tahun kemudian dilantik Insan Natsir sebagai Kepala Sekolah sampai tahun  1982 Kemudian dari tahu 1982 ( dari PGA dirubah menjadi MTs pada tahu 1979 untuk seluruh Republik Indonesia) maka MTs Belakang Padang menjadi MTs Swasta Al-ikhlas. Sebagai Kepala Sekolah Mansur Sauti, BA sampai tahun 1986 dan dari tahun 1986 YP2I mengangkat Bainar Isa, BA sebagai Kepala MTs Swasta Al-Ikhlas kepada Departemen Agama Kota Batam sampai tahun 2004 yang kemudian MTs Swasta Al-ikhlas di Negeri-kan oleh Departemen Agama Provinsi Riau pada tahun tersebut karena YP2I telah menyerahkan seluruh asset MTs Swasta Al-Ikhlas kepada Departemen Agama Kota Batam yang berlokasi di bukit Wahdinah Kampung Jawa Kelurahan Belakang Padang Kecamatan Belakang Padang Kota Batam dengan Batas wilayah

Utara         : SMPN 1 Belakang Padang

Selatan      : Perumahan Penduduk

Barat         : Perumahan Penduduk

Timur         : Perumahan Penduduk

Kemudian pada tahun 1999 MTsN Belakang Padang mendapat pembangunan RKB 3 lokal letak lokasinya dipindahkan di Dapur Arang Kelurahan Belakang Padang Kecamatan Belakang Padang Kota Batam dengan Batas wilayah

Utara         : Desa Dapur Arang

Selatan      : Desa Dapur Arang

Barat         : PT. Sumber Teknik

Timur         : SMPN 2 Belakang Padang Kota Batam

Pada Tahun 2015 berdasarkan Surat Keputusan Menteri Agama Republik Indonesia Nomor 208 Tahun 2015 tentang Perubahan  Nama Madrasah Aliyah Negeri, Madrasah Tsanawiyah Negeri, dan Madrasah Ibtidaiyah Negeri di Provinsi Kepulauan Riau maka MTsN Belakang Padang berganti menjadi MTsN 2 Batam dan membuka Madrasah Filial/Kampus II dilingkungan Kantor Kementerian Agama di Jalan Ir. Sutami No 01 Kelurahan Sungai Harapan Kecamatan Sekupang Kota Batam Provinsi Kepulauan Riau hingga saat ini.

Dan resmi pindah kelokasi baru pada tahun 2000 setelah Kantor Majlis guru siap dibangun.

Adapun susunan kepala sekolah sebagai berikut :

1. Fauzi Mahbub :  1968 - 1970
2. Insan Nastsir :  1970 - 1982
3. Mansur Sauti, BA :  1982 - 1986
4. Bainar Isa, BA :  1986 - 2004
5. Erwin :  2004 - 2008
6. Syamsul Fahrozi :  2008 - 2012
7. Nurainun, S. PdI :  2012 - 2020
8. Sudarsono Limbong, S.PdI :  2020 – 2024
9. Rosmardi, S.Pd : 2024 - Sekarang